Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1d2Q60674 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1d2Q60674 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1d2Q60674 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1d2Q60674 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1d2Q60674 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1d2Q60674 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1d2Q60674 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1d2Q60674 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1d2Q60674 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1d2Q60674 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1d2Q60674 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1d2Q60674 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1d2Q60674 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1d2Q60674 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1d2Q60674 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1d2Q60674 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1d2Q60674 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1d2Q60674 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1d2Q60674 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1d2Q60674 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1d2Q60674 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d2Q60674 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d2Q60674 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d2Q60674 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1d2Q60674 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1d2Q60674 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d2Q60674 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d2Q60674 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d2Q60674 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1d2Q60674 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1d2Q60674 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1d2Q60674 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1d2Q60674 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1d2Q60674 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d2Q60674 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr1d2Q60674 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1d2Q60674 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1d2Q60674 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1d2Q60674 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d2Q60674 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1d2Q60674 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d2Q60674 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d2Q60674 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1d2Q60674 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1d2Q60674 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1d2Q60674 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1d2Q60674 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1d2Q60674 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1d2Q60674 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1d2Q60674 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1d2Q60674 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1d2Q60674 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1d2Q60674 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d2Q60674 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1d2Q60674 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1d2Q60674 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1d2Q60674 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms