Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf15Q5UBV8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf15Q5UBV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf15Q5UBV8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf15Q5UBV8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf15Q5UBV8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf15Q5UBV8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf15Q5UBV8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf15Q5UBV8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf15Q5UBV8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf15Q5UBV8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf15Q5UBV8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf15Q5UBV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf15Q5UBV8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf15Q5UBV8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf15Q5UBV8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf15Q5UBV8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf15Q5UBV8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms