Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cyfip2Q5SQX6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cyfip2Q5SQX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cyfip2Q5SQX6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cyfip2Q5SQX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cyfip2Q5SQX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cyfip2Q5SQX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cyfip2Q5SQX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cyfip2Q5SQX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cyfip2Q5SQX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cyfip2Q5SQX6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cyfip2Q5SQX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cyfip2Q5SQX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cyfip2Q5SQX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyfip2Q5SQX6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyfip2Q5SQX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cyfip2Q5SQX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cyfip2Q5SQX6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cyfip2Q5SQX6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyfip2Q5SQX6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyfip2Q5SQX6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyfip2Q5SQX6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cyfip2Q5SQX6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyfip2Q5SQX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyfip2Q5SQX6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyfip2Q5SQX6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyfip2Q5SQX6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyfip2Q5SQX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyfip2Q5SQX6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyfip2Q5SQX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cyfip2Q5SQX6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyfip2Q5SQX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyfip2Q5SQX6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyfip2Q5SQX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyfip2Q5SQX6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyfip2Q5SQX6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyfip2Q5SQX6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyfip2Q5SQX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cyfip2Q5SQX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cyfip2Q5SQX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyfip2Q5SQX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cyfip2Q5SQX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cyfip2Q5SQX6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyfip2Q5SQX6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyfip2Q5SQX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyfip2Q5SQX6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cyfip2Q5SQX6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyfip2Q5SQX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyfip2Q5SQX6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cyfip2Q5SQX6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cyfip2Q5SQX6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyfip2Q5SQX6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyfip2Q5SQX6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyfip2Q5SQX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cyfip2Q5SQX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cyfip2Q5SQX6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyfip2Q5SQX6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyfip2Q5SQX6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyfip2Q5SQX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyfip2Q5SQX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyfip2Q5SQX6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyfip2Q5SQX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyfip2Q5SQX6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyfip2Q5SQX6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyfip2Q5SQX6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyfip2Q5SQX6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyfip2Q5SQX6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyfip2Q5SQX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyfip2Q5SQX6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyfip2Q5SQX6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyfip2Q5SQX6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyfip2Q5SQX6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyfip2Q5SQX6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyfip2Q5SQX6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyfip2Q5SQX6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyfip2Q5SQX6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyfip2Q5SQX6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyfip2Q5SQX6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms