Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc1Q5NCF2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc1Q5NCF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc1Q5NCF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc1Q5NCF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc1Q5NCF2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc1Q5NCF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc1Q5NCF2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc1Q5NCF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc1Q5NCF2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc1Q5NCF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc1Q5NCF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc1Q5NCF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc1Q5NCF2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc1Q5NCF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc1Q5NCF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc1Q5NCF2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc1Q5NCF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc1Q5NCF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc1Q5NCF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc1Q5NCF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc1Q5NCF2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc1Q5NCF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc1Q5NCF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc1Q5NCF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc1Q5NCF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc1Q5NCF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc1Q5NCF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc1Q5NCF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc1Q5NCF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc1Q5NCF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc1Q5NCF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc1Q5NCF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms