Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrmoQ562D6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrmoQ562D6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrmoQ562D6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrmoQ562D6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrmoQ562D6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrmoQ562D6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrmoQ562D6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrmoQ562D6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrmoQ562D6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrmoQ562D6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrmoQ562D6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrmoQ562D6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrmoQ562D6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrmoQ562D6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrmoQ562D6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrmoQ562D6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrmoQ562D6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrmoQ562D6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrmoQ562D6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrmoQ562D6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrmoQ562D6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrmoQ562D6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrmoQ562D6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrmoQ562D6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrmoQ562D6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrmoQ562D6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrmoQ562D6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrmoQ562D6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrmoQ562D6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrmoQ562D6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TrmoQ562D6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrmoQ562D6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrmoQ562D6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrmoQ562D6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrmoQ562D6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrmoQ562D6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrmoQ562D6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrmoQ562D6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrmoQ562D6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrmoQ562D6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TrmoQ562D6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrmoQ562D6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrmoQ562D6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrmoQ562D6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrmoQ562D6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TrmoQ562D6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TrmoQ562D6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrmoQ562D6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrmoQ562D6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrmoQ562D6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrmoQ562D6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrmoQ562D6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrmoQ562D6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrmoQ562D6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrmoQ562D6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrmoQ562D6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrmoQ562D6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrmoQ562D6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrmoQ562D6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrmoQ562D6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmoQ562D6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms