Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pacs2Q3V3Q7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pacs2Q3V3Q7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pacs2Q3V3Q7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pacs2Q3V3Q7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pacs2Q3V3Q7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pacs2Q3V3Q7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pacs2Q3V3Q7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pacs2Q3V3Q7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pacs2Q3V3Q7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pacs2Q3V3Q7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pacs2Q3V3Q7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pacs2Q3V3Q7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pacs2Q3V3Q7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pacs2Q3V3Q7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pacs2Q3V3Q7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacs2Q3V3Q7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacs2Q3V3Q7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pacs2Q3V3Q7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pacs2Q3V3Q7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs2Q3V3Q7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pacs2Q3V3Q7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacs2Q3V3Q7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacs2Q3V3Q7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pacs2Q3V3Q7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacs2Q3V3Q7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pacs2Q3V3Q7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacs2Q3V3Q7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacs2Q3V3Q7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacs2Q3V3Q7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pacs2Q3V3Q7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacs2Q3V3Q7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacs2Q3V3Q7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pacs2Q3V3Q7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pacs2Q3V3Q7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pacs2Q3V3Q7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs2Q3V3Q7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pacs2Q3V3Q7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pacs2Q3V3Q7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacs2Q3V3Q7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacs2Q3V3Q7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacs2Q3V3Q7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pacs2Q3V3Q7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pacs2Q3V3Q7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pacs2Q3V3Q7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pacs2Q3V3Q7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pacs2Q3V3Q7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacs2Q3V3Q7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacs2Q3V3Q7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pacs2Q3V3Q7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacs2Q3V3Q7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacs2Q3V3Q7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pacs2Q3V3Q7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacs2Q3V3Q7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pacs2Q3V3Q7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacs2Q3V3Q7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pacs2Q3V3Q7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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