Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sel1l2Q3V172 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sel1l2Q3V172 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sel1l2Q3V172 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sel1l2Q3V172 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sel1l2Q3V172 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sel1l2Q3V172 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sel1l2Q3V172 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sel1l2Q3V172 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sel1l2Q3V172 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sel1l2Q3V172 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sel1l2Q3V172 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sel1l2Q3V172 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sel1l2Q3V172 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sel1l2Q3V172 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sel1l2Q3V172 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sel1l2Q3V172 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sel1l2Q3V172 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sel1l2Q3V172 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sel1l2Q3V172 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sel1l2Q3V172 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sel1l2Q3V172 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sel1l2Q3V172 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sel1l2Q3V172 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sel1l2Q3V172 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sel1l2Q3V172 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sel1l2Q3V172 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sel1l2Q3V172 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sel1l2Q3V172 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sel1l2Q3V172 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sel1l2Q3V172 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sel1l2Q3V172 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sel1l2Q3V172 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sel1l2Q3V172 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sel1l2Q3V172 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sel1l2Q3V172 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sel1l2Q3V172 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sel1l2Q3V172 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sel1l2Q3V172 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sel1l2Q3V172 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sel1l2Q3V172 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sel1l2Q3V172 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sel1l2Q3V172 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sel1l2Q3V172 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sel1l2Q3V172 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sel1l2Q3V172 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sel1l2Q3V172 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sel1l2Q3V172 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sel1l2Q3V172 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sel1l2Q3V172 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sel1l2Q3V172 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sel1l2Q3V172 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sel1l2Q3V172 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sel1l2Q3V172 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sel1l2Q3V172 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms