Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700057G04RikQ3V0U0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700057G04RikQ3V0U0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700057G04RikQ3V0U0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700057G04RikQ3V0U0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700057G04RikQ3V0U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700057G04RikQ3V0U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700057G04RikQ3V0U0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700057G04RikQ3V0U0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700057G04RikQ3V0U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700057G04RikQ3V0U0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700057G04RikQ3V0U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700057G04RikQ3V0U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700057G04RikQ3V0U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700057G04RikQ3V0U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700057G04RikQ3V0U0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700057G04RikQ3V0U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700057G04RikQ3V0U0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700057G04RikQ3V0U0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700057G04RikQ3V0U0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700057G04RikQ3V0U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700057G04RikQ3V0U0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700057G04RikQ3V0U0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700057G04RikQ3V0U0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700057G04RikQ3V0U0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700057G04RikQ3V0U0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700057G04RikQ3V0U0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700057G04RikQ3V0U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700057G04RikQ3V0U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700057G04RikQ3V0U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms