Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim80Q3V061 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim80Q3V061 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Trim80Q3V061 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Trim80Q3V061 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim80Q3V061 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim80Q3V061 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim80Q3V061 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim80Q3V061 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim80Q3V061 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim80Q3V061 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim80Q3V061 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Trim80Q3V061 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim80Q3V061 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Trim80Q3V061 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Trim80Q3V061 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Trim80Q3V061 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Trim80Q3V061 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Trim80Q3V061 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Trim80Q3V061 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Trim80Q3V061 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim80Q3V061 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim80Q3V061 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim80Q3V061 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Trim80Q3V061 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Trim80Q3V061 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trim80Q3V061 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trim80Q3V061 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Trim80Q3V061 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trim80Q3V061 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trim80Q3V061 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Trim80Q3V061 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Trim80Q3V061 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trim80Q3V061 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Trim80Q3V061 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim80Q3V061 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim80Q3V061 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trim80Q3V061 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Trim80Q3V061 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Trim80Q3V061 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Trim80Q3V061 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Trim80Q3V061 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Trim80Q3V061 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Trim80Q3V061 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Trim80Q3V061 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Trim80Q3V061 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Trim80Q3V061 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Trim80Q3V061 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Trim80Q3V061 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Trim80Q3V061 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Trim80Q3V061 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Trim80Q3V061 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Trim80Q3V061 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Trim80Q3V061 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Trim80Q3V061 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trim80Q3V061 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Trim80Q3V061 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Trim80Q3V061 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Trim80Q3V061 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Trim80Q3V061 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Trim80Q3V061 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Trim80Q3V061 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Trim80Q3V061 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Trim80Q3V061 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Trim80Q3V061 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Trim80Q3V061 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Trim80Q3V061 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Trim80Q3V061 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,45■■□□□ 1,83
Trim80Q3V061 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Trim80Q3V061 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Trim80Q3V061 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Trim80Q3V061 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Trim80Q3V061 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Trim80Q3V061 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms