Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ccdc27Q3V036 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Ccdc27Q3V036 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Ccdc27Q3V036 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ccdc27Q3V036 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Ccdc27Q3V036 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Ccdc27Q3V036 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ccdc27Q3V036 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ccdc27Q3V036 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ccdc27Q3V036 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Ccdc27Q3V036 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ccdc27Q3V036 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ccdc27Q3V036 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ccdc27Q3V036 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Ccdc27Q3V036 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Ccdc27Q3V036 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ccdc27Q3V036 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Ccdc27Q3V036 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Ccdc27Q3V036 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ccdc27Q3V036 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ccdc27Q3V036 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Ccdc27Q3V036 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ccdc27Q3V036 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ccdc27Q3V036 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Ccdc27Q3V036 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Ccdc27Q3V036 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Ccdc27Q3V036 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ccdc27Q3V036 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ccdc27Q3V036 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccdc27Q3V036 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ccdc27Q3V036 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ccdc27Q3V036 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,78■■■■□ 3
Ccdc27Q3V036 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Ccdc27Q3V036 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ccdc27Q3V036 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ccdc27Q3V036 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Ccdc27Q3V036 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Ccdc27Q3V036 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Ccdc27Q3V036 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Ccdc27Q3V036 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Ccdc27Q3V036 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Ccdc27Q3V036 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Ccdc27Q3V036 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Ccdc27Q3V036 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Ccdc27Q3V036 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Ccdc27Q3V036 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Ccdc27Q3V036 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ccdc27Q3V036 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ccdc27Q3V036 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ccdc27Q3V036 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Ccdc27Q3V036 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Ccdc27Q3V036 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,9
Ccdc27Q3V036 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ccdc27Q3V036 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Ccdc27Q3V036 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Ccdc27Q3V036 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ccdc27Q3V036 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ccdc27Q3V036 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Ccdc27Q3V036 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Ccdc27Q3V036 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Ccdc27Q3V036 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Ccdc27Q3V036 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Ccdc27Q3V036 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Ccdc27Q3V036 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Ccdc27Q3V036 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ccdc27Q3V036 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Ccdc27Q3V036 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Ccdc27Q3V036 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Ccdc27Q3V036 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Ccdc27Q3V036 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Ccdc27Q3V036 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms