Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Skap1Q3UUV5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Skap1Q3UUV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Skap1Q3UUV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Skap1Q3UUV5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Skap1Q3UUV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Skap1Q3UUV5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Skap1Q3UUV5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Skap1Q3UUV5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Skap1Q3UUV5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Skap1Q3UUV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Skap1Q3UUV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Skap1Q3UUV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Skap1Q3UUV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Skap1Q3UUV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Skap1Q3UUV5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Skap1Q3UUV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Skap1Q3UUV5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Skap1Q3UUV5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Skap1Q3UUV5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Skap1Q3UUV5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Skap1Q3UUV5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Skap1Q3UUV5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Skap1Q3UUV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Skap1Q3UUV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Skap1Q3UUV5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Skap1Q3UUV5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Skap1Q3UUV5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Skap1Q3UUV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Skap1Q3UUV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Skap1Q3UUV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Skap1Q3UUV5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Skap1Q3UUV5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Skap1Q3UUV5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Skap1Q3UUV5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Skap1Q3UUV5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Skap1Q3UUV5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Skap1Q3UUV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Skap1Q3UUV5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Skap1Q3UUV5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Skap1Q3UUV5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Skap1Q3UUV5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Skap1Q3UUV5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Skap1Q3UUV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Skap1Q3UUV5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Skap1Q3UUV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Skap1Q3UUV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Skap1Q3UUV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Skap1Q3UUV5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Skap1Q3UUV5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skap1Q3UUV5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Skap1Q3UUV5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Skap1Q3UUV5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Skap1Q3UUV5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Skap1Q3UUV5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Skap1Q3UUV5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Skap1Q3UUV5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Skap1Q3UUV5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Skap1Q3UUV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Skap1Q3UUV5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Skap1Q3UUV5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Skap1Q3UUV5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Skap1Q3UUV5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Skap1Q3UUV5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Skap1Q3UUV5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Skap1Q3UUV5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skap1Q3UUV5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skap1Q3UUV5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skap1Q3UUV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skap1Q3UUV5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skap1Q3UUV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Skap1Q3UUV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms