Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6899Q3USS0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm6899Q3USS0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm6899Q3USS0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm6899Q3USS0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6899Q3USS0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm6899Q3USS0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm6899Q3USS0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm6899Q3USS0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm6899Q3USS0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6899Q3USS0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm6899Q3USS0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm6899Q3USS0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6899Q3USS0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6899Q3USS0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6899Q3USS0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6899Q3USS0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6899Q3USS0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6899Q3USS0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6899Q3USS0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm6899Q3USS0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6899Q3USS0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6899Q3USS0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6899Q3USS0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6899Q3USS0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6899Q3USS0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6899Q3USS0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm6899Q3USS0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6899Q3USS0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6899Q3USS0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6899Q3USS0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6899Q3USS0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6899Q3USS0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6899Q3USS0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6899Q3USS0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6899Q3USS0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6899Q3USS0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6899Q3USS0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6899Q3USS0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6899Q3USS0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6899Q3USS0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm6899Q3USS0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm6899Q3USS0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6899Q3USS0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6899Q3USS0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6899Q3USS0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6899Q3USS0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm6899Q3USS0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm6899Q3USS0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6899Q3USS0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm6899Q3USS0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm6899Q3USS0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm6899Q3USS0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm6899Q3USS0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6899Q3USS0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6899Q3USS0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm6899Q3USS0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6899Q3USS0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6899Q3USS0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6899Q3USS0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6899Q3USS0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6899Q3USS0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6899Q3USS0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6899Q3USS0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6899Q3USS0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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