Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf5Q3UK78 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf5Q3UK78 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf5Q3UK78 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf5Q3UK78 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf5Q3UK78 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf5Q3UK78 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf5Q3UK78 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf5Q3UK78 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf5Q3UK78 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf5Q3UK78 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf5Q3UK78 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf5Q3UK78 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf5Q3UK78 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf5Q3UK78 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf5Q3UK78 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf5Q3UK78 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf5Q3UK78 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf5Q3UK78 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcgf5Q3UK78 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf5Q3UK78 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf5Q3UK78 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcgf5Q3UK78 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf5Q3UK78 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf5Q3UK78 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf5Q3UK78 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcgf5Q3UK78 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcgf5Q3UK78 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf5Q3UK78 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcgf5Q3UK78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf5Q3UK78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf5Q3UK78 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf5Q3UK78 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf5Q3UK78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcgf5Q3UK78 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf5Q3UK78 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf5Q3UK78 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf5Q3UK78 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf5Q3UK78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf5Q3UK78 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcgf5Q3UK78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf5Q3UK78 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf5Q3UK78 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf5Q3UK78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf5Q3UK78 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcgf5Q3UK78 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcgf5Q3UK78 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf5Q3UK78 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf5Q3UK78 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf5Q3UK78 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf5Q3UK78 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf5Q3UK78 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf5Q3UK78 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf5Q3UK78 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf5Q3UK78 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf5Q3UK78 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf5Q3UK78 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf5Q3UK78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf5Q3UK78 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf5Q3UK78 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcgf5Q3UK78 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms