Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nom1Q3UFM5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nom1Q3UFM5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nom1Q3UFM5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nom1Q3UFM5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nom1Q3UFM5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nom1Q3UFM5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nom1Q3UFM5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nom1Q3UFM5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nom1Q3UFM5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nom1Q3UFM5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nom1Q3UFM5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nom1Q3UFM5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nom1Q3UFM5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nom1Q3UFM5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nom1Q3UFM5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nom1Q3UFM5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nom1Q3UFM5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nom1Q3UFM5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nom1Q3UFM5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nom1Q3UFM5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nom1Q3UFM5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nom1Q3UFM5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nom1Q3UFM5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nom1Q3UFM5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nom1Q3UFM5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nom1Q3UFM5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nom1Q3UFM5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nom1Q3UFM5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nom1Q3UFM5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nom1Q3UFM5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nom1Q3UFM5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nom1Q3UFM5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nom1Q3UFM5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nom1Q3UFM5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nom1Q3UFM5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nom1Q3UFM5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nom1Q3UFM5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nom1Q3UFM5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nom1Q3UFM5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nom1Q3UFM5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nom1Q3UFM5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Nom1Q3UFM5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nom1Q3UFM5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nom1Q3UFM5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nom1Q3UFM5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nom1Q3UFM5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nom1Q3UFM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nom1Q3UFM5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nom1Q3UFM5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Nom1Q3UFM5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nom1Q3UFM5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nom1Q3UFM5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Nom1Q3UFM5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nom1Q3UFM5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nom1Q3UFM5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nom1Q3UFM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nom1Q3UFM5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nom1Q3UFM5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nom1Q3UFM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nom1Q3UFM5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nom1Q3UFM5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nom1Q3UFM5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nom1Q3UFM5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nom1Q3UFM5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nom1Q3UFM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nom1Q3UFM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nom1Q3UFM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nom1Q3UFM5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nom1Q3UFM5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nom1Q3UFM5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nom1Q3UFM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nom1Q3UFM5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nom1Q3UFM5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nom1Q3UFM5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nom1Q3UFM5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms