Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smyd5Q3TYX3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Smyd5Q3TYX3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smyd5Q3TYX3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smyd5Q3TYX3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smyd5Q3TYX3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smyd5Q3TYX3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smyd5Q3TYX3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smyd5Q3TYX3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Smyd5Q3TYX3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smyd5Q3TYX3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smyd5Q3TYX3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Smyd5Q3TYX3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smyd5Q3TYX3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smyd5Q3TYX3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smyd5Q3TYX3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smyd5Q3TYX3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smyd5Q3TYX3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smyd5Q3TYX3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smyd5Q3TYX3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smyd5Q3TYX3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smyd5Q3TYX3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smyd5Q3TYX3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smyd5Q3TYX3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smyd5Q3TYX3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smyd5Q3TYX3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Smyd5Q3TYX3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smyd5Q3TYX3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smyd5Q3TYX3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smyd5Q3TYX3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smyd5Q3TYX3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smyd5Q3TYX3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smyd5Q3TYX3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smyd5Q3TYX3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smyd5Q3TYX3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smyd5Q3TYX3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smyd5Q3TYX3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smyd5Q3TYX3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smyd5Q3TYX3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smyd5Q3TYX3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smyd5Q3TYX3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smyd5Q3TYX3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Smyd5Q3TYX3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smyd5Q3TYX3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smyd5Q3TYX3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smyd5Q3TYX3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smyd5Q3TYX3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smyd5Q3TYX3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smyd5Q3TYX3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smyd5Q3TYX3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smyd5Q3TYX3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smyd5Q3TYX3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smyd5Q3TYX3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smyd5Q3TYX3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smyd5Q3TYX3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smyd5Q3TYX3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smyd5Q3TYX3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smyd5Q3TYX3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smyd5Q3TYX3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smyd5Q3TYX3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smyd5Q3TYX3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smyd5Q3TYX3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms