Protein–RNA interactions for Protein: Q3KQP7

Uncharacterized protein C1orf146 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KQP7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KQP7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3KQP7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3KQP7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3KQP7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3KQP7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3KQP7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KQP7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KQP7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3KQP7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3KQP7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3KQP7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3KQP7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3KQP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3KQP7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KQP7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3KQP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3KQP7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3KQP7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3KQP7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KQP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3KQP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3KQP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KQP7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3KQP7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3KQP7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3KQP7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KQP7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KQP7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KQP7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KQP7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3KQP7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3KQP7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3KQP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3KQP7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3KQP7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3KQP7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3KQP7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3KQP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3KQP7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3KQP7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3KQP7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KQP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3KQP7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3KQP7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KQP7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KQP7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3KQP7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KQP7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3KQP7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KQP7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KQP7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms