Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox4dQ2MDG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox4dQ2MDG0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox4dQ2MDG0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox4dQ2MDG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox4dQ2MDG0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox4dQ2MDG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox4dQ2MDG0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox4dQ2MDG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox4dQ2MDG0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox4dQ2MDG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox4dQ2MDG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox4dQ2MDG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox4dQ2MDG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox4dQ2MDG0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox4dQ2MDG0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox4dQ2MDG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhox4dQ2MDG0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rhox4dQ2MDG0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhox4dQ2MDG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox4dQ2MDG0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox4dQ2MDG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rhox4dQ2MDG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox4dQ2MDG0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox4dQ2MDG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox4dQ2MDG0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox4dQ2MDG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox4dQ2MDG0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox4dQ2MDG0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox4dQ2MDG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox4dQ2MDG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox4dQ2MDG0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox4dQ2MDG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox4dQ2MDG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rhox4dQ2MDG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox4dQ2MDG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox4dQ2MDG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox4dQ2MDG0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox4dQ2MDG0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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