Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Edem3Q2HXL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Edem3Q2HXL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Edem3Q2HXL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Edem3Q2HXL6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Edem3Q2HXL6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edem3Q2HXL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Edem3Q2HXL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Edem3Q2HXL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Edem3Q2HXL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Edem3Q2HXL6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms