Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap9Q1HDU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap9Q1HDU4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap9Q1HDU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap9Q1HDU4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap9Q1HDU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap9Q1HDU4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap9Q1HDU4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap9Q1HDU4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgap9Q1HDU4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap9Q1HDU4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap9Q1HDU4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap9Q1HDU4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap9Q1HDU4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap9Q1HDU4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap9Q1HDU4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap9Q1HDU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap9Q1HDU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap9Q1HDU4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap9Q1HDU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap9Q1HDU4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap9Q1HDU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap9Q1HDU4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap9Q1HDU4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap9Q1HDU4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap9Q1HDU4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap9Q1HDU4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap9Q1HDU4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap9Q1HDU4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap9Q1HDU4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap9Q1HDU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap9Q1HDU4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap9Q1HDU4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap9Q1HDU4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap9Q1HDU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap9Q1HDU4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgap9Q1HDU4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap9Q1HDU4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap9Q1HDU4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap9Q1HDU4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap9Q1HDU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap9Q1HDU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap9Q1HDU4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap9Q1HDU4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap9Q1HDU4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap9Q1HDU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap9Q1HDU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms