Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
PepdQ11136 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
PepdQ11136 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
PepdQ11136 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
PepdQ11136 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
PepdQ11136 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
PepdQ11136 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
PepdQ11136 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
PepdQ11136 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,37■■□□□ 1,81
PepdQ11136 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
PepdQ11136 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
PepdQ11136 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
PepdQ11136 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
PepdQ11136 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,1■■□□□ 1,77
PepdQ11136 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
PepdQ11136 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
PepdQ11136 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
PepdQ11136 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
PepdQ11136 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
PepdQ11136 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
PepdQ11136 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
PepdQ11136 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
PepdQ11136 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
PepdQ11136 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
PepdQ11136 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
PepdQ11136 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
PepdQ11136 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,73■■□□□ 1,71
PepdQ11136 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
PepdQ11136 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
PepdQ11136 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
PepdQ11136 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PepdQ11136 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
PepdQ11136 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
PepdQ11136 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
PepdQ11136 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
PepdQ11136 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
PepdQ11136 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
PepdQ11136 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
PepdQ11136 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
PepdQ11136 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
PepdQ11136 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
PepdQ11136 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PepdQ11136 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PepdQ11136 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
PepdQ11136 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
PepdQ11136 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PepdQ11136 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PepdQ11136 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PepdQ11136 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PepdQ11136 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PepdQ11136 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PepdQ11136 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PepdQ11136 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
PepdQ11136 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
PepdQ11136 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
PepdQ11136 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PepdQ11136 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
PepdQ11136 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
PepdQ11136 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PepdQ11136 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
PepdQ11136 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
PepdQ11136 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
PepdQ11136 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
PepdQ11136 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
PepdQ11136 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,11■■□□□ 1,61
PepdQ11136 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PepdQ11136 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms