Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PepdQ11136 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PepdQ11136 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PepdQ11136 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PepdQ11136 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PepdQ11136 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PepdQ11136 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PepdQ11136 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PepdQ11136 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PepdQ11136 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PepdQ11136 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PepdQ11136 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PepdQ11136 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PepdQ11136 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PepdQ11136 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PepdQ11136 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PepdQ11136 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PepdQ11136 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PepdQ11136 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PepdQ11136 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PepdQ11136 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PepdQ11136 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PepdQ11136 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PepdQ11136 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PepdQ11136 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PepdQ11136 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PepdQ11136 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PepdQ11136 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PepdQ11136 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PepdQ11136 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PepdQ11136 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PepdQ11136 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PepdQ11136 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PepdQ11136 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PepdQ11136 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PepdQ11136 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PepdQ11136 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PepdQ11136 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PepdQ11136 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PepdQ11136 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PepdQ11136 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PepdQ11136 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PepdQ11136 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PepdQ11136 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PepdQ11136 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PepdQ11136 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PepdQ11136 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PepdQ11136 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PepdQ11136 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PepdQ11136 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PepdQ11136 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PepdQ11136 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PepdQ11136 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PepdQ11136 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PepdQ11136 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PepdQ11136 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PepdQ11136 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PepdQ11136 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PepdQ11136 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PepdQ11136 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PepdQ11136 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PepdQ11136 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PepdQ11136 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PepdQ11136 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PepdQ11136 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PepdQ11136 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PepdQ11136 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms