Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc138Q0VF22 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc138Q0VF22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc138Q0VF22 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ccdc138Q0VF22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc138Q0VF22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc138Q0VF22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc138Q0VF22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc138Q0VF22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc138Q0VF22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc138Q0VF22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc138Q0VF22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Ccdc138Q0VF22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc138Q0VF22 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc138Q0VF22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc138Q0VF22 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc138Q0VF22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ccdc138Q0VF22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ccdc138Q0VF22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc138Q0VF22 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ccdc138Q0VF22 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc138Q0VF22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc138Q0VF22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ccdc138Q0VF22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc138Q0VF22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ccdc138Q0VF22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc138Q0VF22 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc138Q0VF22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc138Q0VF22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc138Q0VF22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc138Q0VF22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ccdc138Q0VF22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc138Q0VF22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc138Q0VF22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc138Q0VF22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc138Q0VF22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc138Q0VF22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc138Q0VF22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc138Q0VF22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc138Q0VF22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc138Q0VF22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc138Q0VF22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc138Q0VF22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Ccdc138Q0VF22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc138Q0VF22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ccdc138Q0VF22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc138Q0VF22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc138Q0VF22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc138Q0VF22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc138Q0VF22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc138Q0VF22 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc138Q0VF22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc138Q0VF22 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc138Q0VF22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ccdc138Q0VF22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ccdc138Q0VF22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ccdc138Q0VF22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc138Q0VF22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms