Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
SctQ08535 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
SctQ08535 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,47■■□□□ 1,83
SctQ08535 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
SctQ08535 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
SctQ08535 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
SctQ08535 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
SctQ08535 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
SctQ08535 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
SctQ08535 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
SctQ08535 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
SctQ08535 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,32■■□□□ 1,8
SctQ08535 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
SctQ08535 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
SctQ08535 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
SctQ08535 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
SctQ08535 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
SctQ08535 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
SctQ08535 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
SctQ08535 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
SctQ08535 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
SctQ08535 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
SctQ08535 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
SctQ08535 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
SctQ08535 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
SctQ08535 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
SctQ08535 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
SctQ08535 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1,75
SctQ08535 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
SctQ08535 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,99■■□□□ 1,75
SctQ08535 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
SctQ08535 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
SctQ08535 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
SctQ08535 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
SctQ08535 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
SctQ08535 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
SctQ08535 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
SctQ08535 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
SctQ08535 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
SctQ08535 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
SctQ08535 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
SctQ08535 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
SctQ08535 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
SctQ08535 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
SctQ08535 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
SctQ08535 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
SctQ08535 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SctQ08535 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SctQ08535 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SctQ08535 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SctQ08535 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
SctQ08535 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SctQ08535 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SctQ08535 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SctQ08535 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SctQ08535 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
SctQ08535 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
SctQ08535 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
SctQ08535 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
SctQ08535 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SctQ08535 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
SctQ08535 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SctQ08535 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,6■■□□□ 1,69
SctQ08535 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
SctQ08535 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
SctQ08535 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SctQ08535 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SctQ08535 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SctQ08535 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SctQ08535 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
SctQ08535 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
SctQ08535 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SctQ08535 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SctQ08535 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
SctQ08535 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
SctQ08535 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
SctQ08535 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,64
SctQ08535 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
SctQ08535 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
SctQ08535 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
SctQ08535 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
SctQ08535 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
SctQ08535 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
SctQ08535 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
SctQ08535 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
SctQ08535 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
SctQ08535 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
SctQ08535 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
SctQ08535 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
SctQ08535 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
SctQ08535 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
SctQ08535 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
SctQ08535 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
SctQ08535 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
SctQ08535 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
SctQ08535 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
SctQ08535 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
SctQ08535 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
SctQ08535 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
SctQ08535 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms