Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarcad1Q04692 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarcad1Q04692 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarcad1Q04692 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarcad1Q04692 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarcad1Q04692 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smarcad1Q04692 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarcad1Q04692 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smarcad1Q04692 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smarcad1Q04692 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smarcad1Q04692 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarcad1Q04692 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarcad1Q04692 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarcad1Q04692 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarcad1Q04692 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarcad1Q04692 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarcad1Q04692 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarcad1Q04692 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarcad1Q04692 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarcad1Q04692 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarcad1Q04692 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarcad1Q04692 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarcad1Q04692 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcad1Q04692 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcad1Q04692 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcad1Q04692 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarcad1Q04692 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcad1Q04692 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarcad1Q04692 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarcad1Q04692 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarcad1Q04692 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarcad1Q04692 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcad1Q04692 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcad1Q04692 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarcad1Q04692 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarcad1Q04692 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarcad1Q04692 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcad1Q04692 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcad1Q04692 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarcad1Q04692 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcad1Q04692 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcad1Q04692 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarcad1Q04692 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarcad1Q04692 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcad1Q04692 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcad1Q04692 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarcad1Q04692 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarcad1Q04692 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarcad1Q04692 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcad1Q04692 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarcad1Q04692 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcad1Q04692 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcad1Q04692 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcad1Q04692 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcad1Q04692 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcad1Q04692 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarcad1Q04692 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcad1Q04692 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcad1Q04692 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarcad1Q04692 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms