Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1Q01822 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd1Q01822 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1Q01822 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1Q01822 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd1Q01822 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd1Q01822 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd1Q01822 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd1Q01822 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd1Q01822 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd1Q01822 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1Q01822 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1Q01822 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1Q01822 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd1Q01822 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxd1Q01822 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd1Q01822 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd1Q01822 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd1Q01822 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd1Q01822 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd1Q01822 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd1Q01822 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd1Q01822 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd1Q01822 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd1Q01822 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd1Q01822 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd1Q01822 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd1Q01822 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd1Q01822 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd1Q01822 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd1Q01822 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxd1Q01822 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd1Q01822 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd1Q01822 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd1Q01822 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd1Q01822 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd1Q01822 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd1Q01822 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd1Q01822 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxd1Q01822 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd1Q01822 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd1Q01822 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd1Q01822 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxd1Q01822 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd1Q01822 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd1Q01822 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd1Q01822 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd1Q01822 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd1Q01822 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd1Q01822 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd1Q01822 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd1Q01822 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd1Q01822 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd1Q01822 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd1Q01822 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms