Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx2Q00262 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx2Q00262 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx2Q00262 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx2Q00262 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx2Q00262 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stx2Q00262 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx2Q00262 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stx2Q00262 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stx2Q00262 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx2Q00262 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx2Q00262 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx2Q00262 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx2Q00262 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx2Q00262 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx2Q00262 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stx2Q00262 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx2Q00262 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx2Q00262 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx2Q00262 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx2Q00262 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stx2Q00262 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx2Q00262 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx2Q00262 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx2Q00262 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx2Q00262 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx2Q00262 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx2Q00262 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx2Q00262 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx2Q00262 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stx2Q00262 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stx2Q00262 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx2Q00262 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stx2Q00262 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx2Q00262 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stx2Q00262 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx2Q00262 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx2Q00262 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx2Q00262 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stx2Q00262 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stx2Q00262 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx2Q00262 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx2Q00262 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx2Q00262 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx2Q00262 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx2Q00262 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx2Q00262 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx2Q00262 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx2Q00262 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stx2Q00262 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx2Q00262 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx2Q00262 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx2Q00262 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx2Q00262 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx2Q00262 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx2Q00262 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx2Q00262 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx2Q00262 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms