Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited1P97769 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cited1P97769 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cited1P97769 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cited1P97769 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cited1P97769 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cited1P97769 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cited1P97769 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cited1P97769 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cited1P97769 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cited1P97769 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cited1P97769 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cited1P97769 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cited1P97769 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cited1P97769 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited1P97769 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cited1P97769 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cited1P97769 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cited1P97769 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited1P97769 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cited1P97769 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cited1P97769 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cited1P97769 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cited1P97769 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cited1P97769 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cited1P97769 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited1P97769 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited1P97769 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited1P97769 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cited1P97769 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited1P97769 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited1P97769 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cited1P97769 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited1P97769 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms