Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas1P97459 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas1P97459 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas1P97459 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas1P97459 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas1P97459 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas1P97459 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas1P97459 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas1P97459 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas1P97459 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas1P97459 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas1P97459 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas1P97459 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas1P97459 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas1P97459 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npas1P97459 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npas1P97459 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas1P97459 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas1P97459 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas1P97459 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas1P97459 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas1P97459 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas1P97459 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas1P97459 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas1P97459 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas1P97459 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas1P97459 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas1P97459 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas1P97459 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas1P97459 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas1P97459 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas1P97459 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas1P97459 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npas1P97459 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas1P97459 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas1P97459 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Npas1P97459 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npas1P97459 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npas1P97459 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npas1P97459 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npas1P97459 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas1P97459 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Npas1P97459 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Npas1P97459 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas1P97459 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Npas1P97459 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas1P97459 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas1P97459 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas1P97459 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms