Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
H3f3aP84244 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
H3f3aP84244 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
H3f3aP84244 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,73■■□□□ 1,55
H3f3aP84244 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
H3f3aP84244 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
H3f3aP84244 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
H3f3aP84244 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
H3f3aP84244 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
H3f3aP84244 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
H3f3aP84244 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
H3f3aP84244 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
H3f3aP84244 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
H3f3aP84244 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
H3f3aP84244 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,58■■□□□ 1,53
H3f3aP84244 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
H3f3aP84244 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
H3f3aP84244 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
H3f3aP84244 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
H3f3aP84244 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
H3f3aP84244 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
H3f3aP84244 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
H3f3aP84244 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
H3f3aP84244 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
H3f3aP84244 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
H3f3aP84244 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
H3f3aP84244 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
H3f3aP84244 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,48
H3f3aP84244 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
H3f3aP84244 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
H3f3aP84244 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,27■■□□□ 1,48
H3f3aP84244 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
H3f3aP84244 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,22■■□□□ 1,47
H3f3aP84244 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
H3f3aP84244 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
H3f3aP84244 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
H3f3aP84244 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
H3f3aP84244 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
H3f3aP84244 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
H3f3aP84244 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
H3f3aP84244 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,46
H3f3aP84244 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
H3f3aP84244 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,12■■□□□ 1,45
H3f3aP84244 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
H3f3aP84244 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
H3f3aP84244 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
H3f3aP84244 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
H3f3aP84244 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
H3f3aP84244 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
H3f3aP84244 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
H3f3aP84244 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,93■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
H3f3aP84244 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
H3f3aP84244 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
H3f3aP84244 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
H3f3aP84244 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,77■■□□□ 1,4
H3f3aP84244 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,76■■□□□ 1,39
H3f3aP84244 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
H3f3aP84244 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
H3f3aP84244 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
H3f3aP84244 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
H3f3aP84244 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
H3f3aP84244 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
H3f3aP84244 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
H3f3aP84244 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
H3f3aP84244 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
H3f3aP84244 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
H3f3aP84244 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
H3f3aP84244 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
H3f3aP84244 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
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