Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arf1P84078 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arf1P84078 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arf1P84078 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arf1P84078 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arf1P84078 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arf1P84078 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arf1P84078 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arf1P84078 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arf1P84078 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arf1P84078 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arf1P84078 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf1P84078 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arf1P84078 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arf1P84078 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arf1P84078 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arf1P84078 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arf1P84078 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arf1P84078 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arf1P84078 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arf1P84078 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arf1P84078 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arf1P84078 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arf1P84078 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arf1P84078 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arf1P84078 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arf1P84078 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arf1P84078 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arf1P84078 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arf1P84078 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf1P84078 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arf1P84078 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arf1P84078 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arf1P84078 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arf1P84078 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arf1P84078 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arf1P84078 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Arf1P84078 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arf1P84078 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arf1P84078 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arf1P84078 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Arf1P84078 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arf1P84078 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arf1P84078 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arf1P84078 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arf1P84078 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arf1P84078 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arf1P84078 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arf1P84078 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arf1P84078 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arf1P84078 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arf1P84078 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arf1P84078 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arf1P84078 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Arf1P84078 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arf1P84078 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arf1P84078 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arf1P84078 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arf1P84078 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arf1P84078 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf1P84078 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf1P84078 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arf1P84078 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arf1P84078 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf1P84078 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arf1P84078 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arf1P84078 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf1P84078 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf1P84078 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arf1P84078 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arf1P84078 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arf1P84078 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arf1P84078 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms