Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rad50P70388 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rad50P70388 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rad50P70388 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rad50P70388 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rad50P70388 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rad50P70388 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rad50P70388 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rad50P70388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rad50P70388 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rad50P70388 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rad50P70388 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rad50P70388 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rad50P70388 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Rad50P70388 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rad50P70388 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rad50P70388 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rad50P70388 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rad50P70388 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rad50P70388 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rad50P70388 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Rad50P70388 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rad50P70388 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rad50P70388 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rad50P70388 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rad50P70388 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rad50P70388 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rad50P70388 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rad50P70388 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rad50P70388 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rad50P70388 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rad50P70388 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Rad50P70388 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rad50P70388 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rad50P70388 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rad50P70388 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rad50P70388 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rad50P70388 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rad50P70388 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad50P70388 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad50P70388 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad50P70388 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rad50P70388 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rad50P70388 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rad50P70388 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rad50P70388 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rad50P70388 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rad50P70388 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rad50P70388 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rad50P70388 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rad50P70388 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rad50P70388 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rad50P70388 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad50P70388 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rad50P70388 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rad50P70388 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rad50P70388 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rad50P70388 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rad50P70388 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rad50P70388 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rad50P70388 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rad50P70388 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad50P70388 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rad50P70388 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rad50P70388 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Rad50P70388 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rad50P70388 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rad50P70388 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rad50P70388 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rad50P70388 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rad50P70388 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Rad50P70388 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rad50P70388 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rad50P70388 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rad50P70388 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rad50P70388 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rad50P70388 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rad50P70388 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rad50P70388 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms