Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac2P70288 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac2P70288 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hdac2P70288 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac2P70288 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac2P70288 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac2P70288 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac2P70288 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac2P70288 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac2P70288 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac2P70288 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac2P70288 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac2P70288 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac2P70288 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac2P70288 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac2P70288 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac2P70288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac2P70288 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac2P70288 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac2P70288 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac2P70288 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac2P70288 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac2P70288 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac2P70288 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac2P70288 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac2P70288 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac2P70288 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac2P70288 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac2P70288 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac2P70288 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac2P70288 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac2P70288 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac2P70288 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac2P70288 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac2P70288 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac2P70288 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac2P70288 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac2P70288 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac2P70288 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac2P70288 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac2P70288 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac2P70288 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac2P70288 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac2P70288 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac2P70288 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac2P70288 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac2P70288 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac2P70288 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac2P70288 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac2P70288 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac2P70288 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac2P70288 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac2P70288 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms