Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
CalcaP70160 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
CalcaP70160 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,69■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,68■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
CalcaP70160 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
CalcaP70160 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
CalcaP70160 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,55■■■□□ 2,96
CalcaP70160 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,54■■■□□ 2,96
CalcaP70160 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
CalcaP70160 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
CalcaP70160 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
CalcaP70160 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
CalcaP70160 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
CalcaP70160 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
CalcaP70160 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
CalcaP70160 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
CalcaP70160 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
CalcaP70160 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
CalcaP70160 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
CalcaP70160 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
CalcaP70160 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
CalcaP70160 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
CalcaP70160 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,25■■■□□ 2,91
CalcaP70160 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
CalcaP70160 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
CalcaP70160 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
CalcaP70160 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,12■■■□□ 2,89
CalcaP70160 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
CalcaP70160 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
CalcaP70160 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
CalcaP70160 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
CalcaP70160 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
CalcaP70160 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
CalcaP70160 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
CalcaP70160 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
CalcaP70160 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
CalcaP70160 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
CalcaP70160 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
CalcaP70160 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
CalcaP70160 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
CalcaP70160 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
CalcaP70160 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
CalcaP70160 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
CalcaP70160 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
CalcaP70160 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
CalcaP70160 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
CalcaP70160 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
CalcaP70160 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
CalcaP70160 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,68■■■□□ 2,82
CalcaP70160 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
CalcaP70160 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
CalcaP70160 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
CalcaP70160 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
CalcaP70160 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,55■■■□□ 2,8
CalcaP70160 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
CalcaP70160 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
CalcaP70160 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,41■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
CalcaP70160 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
CalcaP70160 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
CalcaP70160 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
CalcaP70160 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
CalcaP70160 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
CalcaP70160 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,23■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
CalcaP70160 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
CalcaP70160 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
CalcaP70160 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
CalcaP70160 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,16■■■□□ 2,74
CalcaP70160 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
CalcaP70160 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,12■■■□□ 2,73
CalcaP70160 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
CalcaP70160 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
CalcaP70160 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
CalcaP70160 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,07■■■□□ 2,72
CalcaP70160 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
CalcaP70160 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
CalcaP70160 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
CalcaP70160 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
CalcaP70160 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,95■■■□□ 2,71
CalcaP70160 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
CalcaP70160 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,7
CalcaP70160 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms