Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Crip1P63254 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Crip1P63254 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Crip1P63254 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Crip1P63254 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Crip1P63254 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Crip1P63254 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Crip1P63254 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Crip1P63254 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Crip1P63254 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Crip1P63254 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Crip1P63254 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Crip1P63254 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Crip1P63254 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Crip1P63254 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Crip1P63254 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Crip1P63254 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Crip1P63254 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Crip1P63254 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Crip1P63254 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Crip1P63254 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Crip1P63254 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Crip1P63254 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Crip1P63254 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Crip1P63254 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Crip1P63254 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Crip1P63254 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Crip1P63254 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Crip1P63254 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Crip1P63254 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Crip1P63254 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Crip1P63254 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Crip1P63254 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Crip1P63254 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Crip1P63254 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,6■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Crip1P63254 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Crip1P63254 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Crip1P63254 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,87
Crip1P63254 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Crip1P63254 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Crip1P63254 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,4■□□□□ 0,86
Crip1P63254 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Crip1P63254 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Crip1P63254 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Crip1P63254 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Crip1P63254 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Crip1P63254 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Crip1P63254 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Crip1P63254 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Crip1P63254 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Crip1P63254 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,16■□□□□ 0,82
Crip1P63254 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Crip1P63254 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Crip1P63254 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Crip1P63254 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms