Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab3aP63011 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab3aP63011 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab3aP63011 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab3aP63011 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab3aP63011 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab3aP63011 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab3aP63011 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab3aP63011 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab3aP63011 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab3aP63011 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab3aP63011 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab3aP63011 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab3aP63011 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab3aP63011 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab3aP63011 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab3aP63011 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3aP63011 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3aP63011 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3aP63011 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3aP63011 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3aP63011 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab3aP63011 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3aP63011 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3aP63011 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3aP63011 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3aP63011 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab3aP63011 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3aP63011 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab3aP63011 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab3aP63011 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab3aP63011 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3aP63011 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab3aP63011 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab3aP63011 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3aP63011 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab3aP63011 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab3aP63011 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3aP63011 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3aP63011 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3aP63011 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3aP63011 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3aP63011 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3aP63011 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3aP63011 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3aP63011 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3aP63011 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3aP63011 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3aP63011 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3aP63011 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3aP63011 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3aP63011 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3aP63011 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3aP63011 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3aP63011 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3aP63011 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3aP63011 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3aP63011 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3aP63011 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3aP63011 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab3aP63011 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3aP63011 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3aP63011 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms