Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gnb1P62874 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gnb1P62874 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gnb1P62874 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gnb1P62874 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gnb1P62874 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gnb1P62874 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gnb1P62874 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gnb1P62874 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gnb1P62874 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnb1P62874 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gnb1P62874 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gnb1P62874 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnb1P62874 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gnb1P62874 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gnb1P62874 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gnb1P62874 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gnb1P62874 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gnb1P62874 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnb1P62874 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gnb1P62874 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gnb1P62874 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnb1P62874 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gnb1P62874 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gnb1P62874 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnb1P62874 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnb1P62874 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnb1P62874 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnb1P62874 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnb1P62874 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnb1P62874 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gnb1P62874 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gnb1P62874 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gnb1P62874 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gnb1P62874 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gnb1P62874 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gnb1P62874 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gnb1P62874 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gnb1P62874 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gnb1P62874 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gnb1P62874 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gnb1P62874 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gnb1P62874 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnb1P62874 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gnb1P62874 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnb1P62874 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnb1P62874 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gnb1P62874 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gnb1P62874 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gnb1P62874 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gnb1P62874 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gnb1P62874 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gnb1P62874 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gnb1P62874 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnb1P62874 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gnb1P62874 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gnb1P62874 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gnb1P62874 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gnb1P62874 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms