Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl18aP62717 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl18aP62717 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl18aP62717 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl18aP62717 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl18aP62717 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl18aP62717 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl18aP62717 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl18aP62717 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl18aP62717 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl18aP62717 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl18aP62717 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl18aP62717 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl18aP62717 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl18aP62717 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl18aP62717 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl18aP62717 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl18aP62717 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl18aP62717 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl18aP62717 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl18aP62717 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl18aP62717 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl18aP62717 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl18aP62717 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl18aP62717 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl18aP62717 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms