Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps29P62274 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps29P62274 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps29P62274 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps29P62274 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps29P62274 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps29P62274 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps29P62274 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps29P62274 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps29P62274 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps29P62274 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps29P62274 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps29P62274 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps29P62274 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps29P62274 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps29P62274 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps29P62274 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps29P62274 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps29P62274 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps29P62274 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps29P62274 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps29P62274 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps29P62274 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps29P62274 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps29P62274 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps29P62274 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps29P62274 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps29P62274 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps29P62274 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps29P62274 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps29P62274 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps29P62274 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps29P62274 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps29P62274 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps29P62274 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps29P62274 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps29P62274 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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