Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctbp2P56546 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctbp2P56546 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctbp2P56546 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctbp2P56546 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctbp2P56546 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctbp2P56546 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctbp2P56546 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctbp2P56546 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctbp2P56546 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctbp2P56546 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctbp2P56546 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctbp2P56546 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctbp2P56546 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctbp2P56546 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctbp2P56546 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctbp2P56546 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctbp2P56546 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctbp2P56546 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctbp2P56546 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctbp2P56546 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctbp2P56546 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctbp2P56546 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctbp2P56546 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctbp2P56546 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctbp2P56546 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctbp2P56546 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctbp2P56546 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctbp2P56546 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctbp2P56546 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctbp2P56546 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctbp2P56546 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctbp2P56546 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctbp2P56546 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctbp2P56546 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctbp2P56546 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctbp2P56546 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctbp2P56546 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctbp2P56546 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctbp2P56546 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctbp2P56546 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctbp2P56546 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctbp2P56546 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctbp2P56546 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctbp2P56546 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctbp2P56546 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctbp2P56546 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctbp2P56546 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctbp2P56546 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctbp2P56546 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctbp2P56546 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctbp2P56546 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms