Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpn5P54830 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpn5P54830 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptpn5P54830 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn5P54830 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpn5P54830 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptpn5P54830 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptpn5P54830 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpn5P54830 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptpn5P54830 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpn5P54830 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpn5P54830 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpn5P54830 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpn5P54830 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpn5P54830 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn5P54830 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn5P54830 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn5P54830 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn5P54830 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn5P54830 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn5P54830 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn5P54830 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn5P54830 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn5P54830 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn5P54830 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn5P54830 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn5P54830 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn5P54830 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptpn5P54830 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ptpn5P54830 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn5P54830 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptpn5P54830 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn5P54830 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn5P54830 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn5P54830 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn5P54830 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn5P54830 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptpn5P54830 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn5P54830 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn5P54830 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptpn5P54830 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptpn5P54830 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptpn5P54830 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ptpn5P54830 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ptpn5P54830 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ptpn5P54830 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ptpn5P54830 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ptpn5P54830 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptpn5P54830 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpn5P54830 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpn5P54830 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpn5P54830 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpn5P54830 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn5P54830 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn5P54830 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptpn5P54830 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn5P54830 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn5P54830 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn5P54830 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn5P54830 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn5P54830 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn5P54830 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn5P54830 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ptpn5P54830 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ptpn5P54830 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ptpn5P54830 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpn5P54830 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpn5P54830 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn5P54830 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpn5P54830 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpn5P54830 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpn5P54830 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpn5P54830 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ptpn5P54830 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpn5P54830 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpn5P54830 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpn5P54830 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpn5P54830 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpn5P54830 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms