Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Faf1P54731 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Faf1P54731 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Faf1P54731 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Faf1P54731 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Faf1P54731 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Faf1P54731 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Faf1P54731 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Faf1P54731 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Faf1P54731 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Faf1P54731 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Faf1P54731 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Faf1P54731 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Faf1P54731 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Faf1P54731 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Faf1P54731 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Faf1P54731 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Faf1P54731 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Faf1P54731 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Faf1P54731 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Faf1P54731 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Faf1P54731 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Faf1P54731 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Faf1P54731 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Faf1P54731 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Faf1P54731 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Faf1P54731 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Faf1P54731 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Faf1P54731 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Faf1P54731 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Faf1P54731 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Faf1P54731 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Faf1P54731 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Faf1P54731 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Faf1P54731 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Faf1P54731 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Faf1P54731 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Faf1P54731 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Faf1P54731 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Faf1P54731 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,33■■□□□ 1,64
Faf1P54731 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Faf1P54731 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Faf1P54731 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Faf1P54731 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Faf1P54731 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Faf1P54731 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Faf1P54731 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Faf1P54731 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Faf1P54731 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Faf1P54731 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Faf1P54731 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Faf1P54731 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Faf1P54731 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Faf1P54731 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Faf1P54731 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Faf1P54731 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Faf1P54731 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Faf1P54731 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Faf1P54731 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Faf1P54731 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Faf1P54731 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms