Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DbtP53395 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DbtP53395 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DbtP53395 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DbtP53395 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DbtP53395 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DbtP53395 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DbtP53395 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DbtP53395 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DbtP53395 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DbtP53395 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DbtP53395 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DbtP53395 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DbtP53395 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DbtP53395 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DbtP53395 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DbtP53395 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DbtP53395 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DbtP53395 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DbtP53395 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DbtP53395 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DbtP53395 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DbtP53395 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DbtP53395 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DbtP53395 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DbtP53395 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DbtP53395 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DbtP53395 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DbtP53395 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DbtP53395 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DbtP53395 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DbtP53395 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DbtP53395 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DbtP53395 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DbtP53395 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DbtP53395 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DbtP53395 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DbtP53395 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DbtP53395 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DbtP53395 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DbtP53395 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DbtP53395 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DbtP53395 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DbtP53395 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DbtP53395 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DbtP53395 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DbtP53395 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DbtP53395 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DbtP53395 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DbtP53395 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DbtP53395 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DbtP53395 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DbtP53395 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DbtP53395 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DbtP53395 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DbtP53395 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DbtP53395 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DbtP53395 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DbtP53395 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DbtP53395 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DbtP53395 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DbtP53395 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DbtP53395 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DbtP53395 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DbtP53395 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DbtP53395 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DbtP53395 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DbtP53395 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DbtP53395 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DbtP53395 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DbtP53395 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DbtP53395 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DbtP53395 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DbtP53395 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DbtP53395 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DbtP53395 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DbtP53395 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DbtP53395 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DbtP53395 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DbtP53395 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DbtP53395 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DbtP53395 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DbtP53395 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DbtP53395 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DbtP53395 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DbtP53395 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DbtP53395 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DbtP53395 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DbtP53395 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DbtP53395 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DbtP53395 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DbtP53395 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DbtP53395 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DbtP53395 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DbtP53395 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DbtP53395 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DbtP53395 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DbtP53395 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DbtP53395 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DbtP53395 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms