Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fgd1P52734 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fgd1P52734 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fgd1P52734 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Fgd1P52734 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fgd1P52734 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fgd1P52734 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fgd1P52734 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fgd1P52734 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fgd1P52734 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fgd1P52734 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fgd1P52734 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fgd1P52734 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fgd1P52734 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fgd1P52734 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fgd1P52734 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fgd1P52734 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fgd1P52734 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fgd1P52734 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fgd1P52734 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fgd1P52734 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fgd1P52734 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fgd1P52734 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fgd1P52734 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fgd1P52734 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Fgd1P52734 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fgd1P52734 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd1P52734 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd1P52734 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd1P52734 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fgd1P52734 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd1P52734 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fgd1P52734 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd1P52734 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd1P52734 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd1P52734 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Fgd1P52734 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fgd1P52734 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fgd1P52734 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Fgd1P52734 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fgd1P52734 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fgd1P52734 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Fgd1P52734 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fgd1P52734 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fgd1P52734 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fgd1P52734 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fgd1P52734 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fgd1P52734 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fgd1P52734 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd1P52734 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd1P52734 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fgd1P52734 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fgd1P52734 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fgd1P52734 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Fgd1P52734 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Fgd1P52734 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd1P52734 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fgd1P52734 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fgd1P52734 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fgd1P52734 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd1P52734 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fgd1P52734 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fgd1P52734 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fgd1P52734 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fgd1P52734 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fgd1P52734 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fgd1P52734 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Fgd1P52734 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fgd1P52734 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fgd1P52734 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fgd1P52734 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fgd1P52734 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fgd1P52734 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fgd1P52734 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fgd1P52734 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fgd1P52734 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fgd1P52734 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Fgd1P52734 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Fgd1P52734 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fgd1P52734 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fgd1P52734 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fgd1P52734 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fgd1P52734 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fgd1P52734 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fgd1P52734 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fgd1P52734 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms