Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FmodP50608 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FmodP50608 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FmodP50608 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FmodP50608 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FmodP50608 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FmodP50608 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FmodP50608 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FmodP50608 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FmodP50608 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FmodP50608 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FmodP50608 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FmodP50608 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FmodP50608 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FmodP50608 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FmodP50608 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FmodP50608 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FmodP50608 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FmodP50608 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FmodP50608 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FmodP50608 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FmodP50608 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FmodP50608 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FmodP50608 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FmodP50608 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FmodP50608 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FmodP50608 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FmodP50608 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FmodP50608 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FmodP50608 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FmodP50608 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FmodP50608 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FmodP50608 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FmodP50608 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FmodP50608 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FmodP50608 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FmodP50608 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FmodP50608 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FmodP50608 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FmodP50608 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FmodP50608 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FmodP50608 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FmodP50608 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FmodP50608 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FmodP50608 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FmodP50608 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FmodP50608 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FmodP50608 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FmodP50608 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FmodP50608 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FmodP50608 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FmodP50608 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FmodP50608 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FmodP50608 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FmodP50608 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FmodP50608 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FmodP50608 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FmodP50608 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FmodP50608 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FmodP50608 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FmodP50608 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FmodP50608 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FmodP50608 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FmodP50608 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FmodP50608 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FmodP50608 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FmodP50608 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FmodP50608 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FmodP50608 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FmodP50608 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FmodP50608 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FmodP50608 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FmodP50608 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FmodP50608 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FmodP50608 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FmodP50608 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FmodP50608 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FmodP50608 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FmodP50608 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FmodP50608 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FmodP50608 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FmodP50608 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FmodP50608 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FmodP50608 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FmodP50608 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FmodP50608 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FmodP50608 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FmodP50608 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FmodP50608 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FmodP50608 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FmodP50608 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FmodP50608 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FmodP50608 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FmodP50608 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FmodP50608 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FmodP50608 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FmodP50608 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FmodP50608 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FmodP50608 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FmodP50608 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms