Protein–RNA interactions for Protein: P49586

Pcyt1a, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcyt1aP49586 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcyt1aP49586 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcyt1aP49586 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcyt1aP49586 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcyt1aP49586 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcyt1aP49586 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcyt1aP49586 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcyt1aP49586 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcyt1aP49586 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcyt1aP49586 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcyt1aP49586 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcyt1aP49586 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcyt1aP49586 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcyt1aP49586 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcyt1aP49586 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcyt1aP49586 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcyt1aP49586 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcyt1aP49586 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcyt1aP49586 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcyt1aP49586 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcyt1aP49586 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcyt1aP49586 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcyt1aP49586 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcyt1aP49586 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcyt1aP49586 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcyt1aP49586 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcyt1aP49586 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcyt1aP49586 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcyt1aP49586 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcyt1aP49586 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcyt1aP49586 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcyt1aP49586 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcyt1aP49586 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcyt1aP49586 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcyt1aP49586 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcyt1aP49586 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcyt1aP49586 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcyt1aP49586 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcyt1aP49586 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcyt1aP49586 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcyt1aP49586 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcyt1aP49586 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcyt1aP49586 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcyt1aP49586 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcyt1aP49586 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcyt1aP49586 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcyt1aP49586 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcyt1aP49586 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcyt1aP49586 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcyt1aP49586 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcyt1aP49586 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcyt1aP49586 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcyt1aP49586 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcyt1aP49586 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcyt1aP49586 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms