Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
InaP46660 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
InaP46660 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
InaP46660 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
InaP46660 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
InaP46660 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
InaP46660 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
InaP46660 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
InaP46660 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
InaP46660 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
InaP46660 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
InaP46660 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
InaP46660 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
InaP46660 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
InaP46660 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
InaP46660 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
InaP46660 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
InaP46660 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
InaP46660 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
InaP46660 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
InaP46660 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
InaP46660 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
InaP46660 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
InaP46660 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
InaP46660 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
InaP46660 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
InaP46660 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
InaP46660 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
InaP46660 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
InaP46660 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
InaP46660 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
InaP46660 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
InaP46660 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
InaP46660 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
InaP46660 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
InaP46660 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
InaP46660 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
InaP46660 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
InaP46660 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
InaP46660 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
InaP46660 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
InaP46660 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
InaP46660 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
InaP46660 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
InaP46660 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
InaP46660 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
InaP46660 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
InaP46660 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
InaP46660 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
InaP46660 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
InaP46660 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
InaP46660 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
InaP46660 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
InaP46660 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
InaP46660 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
InaP46660 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
InaP46660 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
InaP46660 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
InaP46660 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
InaP46660 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
InaP46660 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
InaP46660 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
InaP46660 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
InaP46660 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
InaP46660 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
InaP46660 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
InaP46660 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
InaP46660 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
InaP46660 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
InaP46660 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
InaP46660 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
InaP46660 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
InaP46660 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
InaP46660 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
InaP46660 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
InaP46660 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
InaP46660 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
InaP46660 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
InaP46660 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
InaP46660 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
InaP46660 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
InaP46660 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
InaP46660 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
InaP46660 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
InaP46660 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
InaP46660 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
InaP46660 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
InaP46660 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
InaP46660 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
InaP46660 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
InaP46660 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
InaP46660 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
InaP46660 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
InaP46660 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
InaP46660 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
InaP46660 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
InaP46660 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
InaP46660 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
InaP46660 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
InaP46660 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms