Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nkx1-2P42580 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nkx1-2P42580 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nkx1-2P42580 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nkx1-2P42580 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nkx1-2P42580 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nkx1-2P42580 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nkx1-2P42580 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Nkx1-2P42580 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nkx1-2P42580 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nkx1-2P42580 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nkx1-2P42580 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nkx1-2P42580 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nkx1-2P42580 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nkx1-2P42580 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nkx1-2P42580 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nkx1-2P42580 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nkx1-2P42580 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nkx1-2P42580 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nkx1-2P42580 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nkx1-2P42580 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Nkx1-2P42580 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nkx1-2P42580 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Nkx1-2P42580 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nkx1-2P42580 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nkx1-2P42580 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nkx1-2P42580 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nkx1-2P42580 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Nkx1-2P42580 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nkx1-2P42580 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nkx1-2P42580 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nkx1-2P42580 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nkx1-2P42580 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nkx1-2P42580 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nkx1-2P42580 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nkx1-2P42580 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nkx1-2P42580 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nkx1-2P42580 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nkx1-2P42580 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nkx1-2P42580 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nkx1-2P42580 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nkx1-2P42580 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nkx1-2P42580 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nkx1-2P42580 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nkx1-2P42580 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nkx1-2P42580 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nkx1-2P42580 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Nkx1-2P42580 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nkx1-2P42580 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Nkx1-2P42580 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nkx1-2P42580 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nkx1-2P42580 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nkx1-2P42580 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Nkx1-2P42580 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nkx1-2P42580 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms