Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbP41155 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbP41155 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbP41155 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LtbP41155 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LtbP41155 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbP41155 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbP41155 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbP41155 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtbP41155 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbP41155 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbP41155 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbP41155 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbP41155 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbP41155 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbP41155 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbP41155 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbP41155 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbP41155 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbP41155 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbP41155 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbP41155 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbP41155 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbP41155 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbP41155 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbP41155 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbP41155 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LtbP41155 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbP41155 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LtbP41155 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LtbP41155 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LtbP41155 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LtbP41155 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbP41155 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbP41155 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LtbP41155 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LtbP41155 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbP41155 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbP41155 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbP41155 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbP41155 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbP41155 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbP41155 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbP41155 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbP41155 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LtbP41155 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbP41155 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbP41155 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LtbP41155 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LtbP41155 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbP41155 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LtbP41155 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LtbP41155 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LtbP41155 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbP41155 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LtbP41155 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LtbP41155 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbP41155 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LtbP41155 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbP41155 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LtbP41155 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LtbP41155 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LtbP41155 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbP41155 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbP41155 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbP41155 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbP41155 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbP41155 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbP41155 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbP41155 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbP41155 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbP41155 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbP41155 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbP41155 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbP41155 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbP41155 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbP41155 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbP41155 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtbP41155 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbP41155 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbP41155 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbP41155 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbP41155 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbP41155 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbP41155 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbP41155 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbP41155 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbP41155 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbP41155 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbP41155 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbP41155 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbP41155 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbP41155 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbP41155 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbP41155 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbP41155 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbP41155 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbP41155 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbP41155 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbP41155 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms