Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stfa1P35175 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa1P35175 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stfa1P35175 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stfa1P35175 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stfa1P35175 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stfa1P35175 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stfa1P35175 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stfa1P35175 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stfa1P35175 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stfa1P35175 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stfa1P35175 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stfa1P35175 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stfa1P35175 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stfa1P35175 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stfa1P35175 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stfa1P35175 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stfa1P35175 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stfa1P35175 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stfa1P35175 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stfa1P35175 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stfa1P35175 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa1P35175 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stfa1P35175 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stfa1P35175 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stfa1P35175 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stfa1P35175 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stfa1P35175 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stfa1P35175 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stfa1P35175 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stfa1P35175 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stfa1P35175 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stfa1P35175 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stfa1P35175 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stfa1P35175 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stfa1P35175 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stfa1P35175 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa1P35175 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stfa1P35175 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stfa1P35175 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stfa1P35175 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stfa1P35175 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stfa1P35175 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stfa1P35175 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stfa1P35175 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stfa1P35175 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stfa1P35175 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stfa1P35175 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms