Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc5P32043 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc5P32043 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc5P32043 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc5P32043 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc5P32043 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc5P32043 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc5P32043 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc5P32043 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc5P32043 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc5P32043 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc5P32043 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc5P32043 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc5P32043 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc5P32043 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc5P32043 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc5P32043 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc5P32043 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc5P32043 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc5P32043 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc5P32043 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc5P32043 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc5P32043 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc5P32043 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc5P32043 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc5P32043 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc5P32043 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc5P32043 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc5P32043 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc5P32043 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc5P32043 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc5P32043 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc5P32043 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc5P32043 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc5P32043 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc5P32043 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc5P32043 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc5P32043 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc5P32043 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc5P32043 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc5P32043 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc5P32043 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc5P32043 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc5P32043 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc5P32043 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc5P32043 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc5P32043 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc5P32043 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc5P32043 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc5P32043 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms