Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gjc1P28229 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjc1P28229 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjc1P28229 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjc1P28229 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjc1P28229 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjc1P28229 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gjc1P28229 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjc1P28229 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjc1P28229 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjc1P28229 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjc1P28229 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gjc1P28229 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjc1P28229 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjc1P28229 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjc1P28229 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gjc1P28229 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjc1P28229 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gjc1P28229 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjc1P28229 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gjc1P28229 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gjc1P28229 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gjc1P28229 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gjc1P28229 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gjc1P28229 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjc1P28229 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjc1P28229 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gjc1P28229 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gjc1P28229 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gjc1P28229 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gjc1P28229 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gjc1P28229 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gjc1P28229 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjc1P28229 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gjc1P28229 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjc1P28229 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gjc1P28229 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjc1P28229 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjc1P28229 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjc1P28229 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gjc1P28229 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gjc1P28229 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gjc1P28229 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjc1P28229 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjc1P28229 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjc1P28229 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjc1P28229 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjc1P28229 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjc1P28229 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjc1P28229 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjc1P28229 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjc1P28229 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjc1P28229 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjc1P28229 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gjc1P28229 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjc1P28229 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjc1P28229 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjc1P28229 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gjc1P28229 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjc1P28229 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gjc1P28229 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjc1P28229 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjc1P28229 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjc1P28229 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjc1P28229 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjc1P28229 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjc1P28229 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gjc1P28229 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjc1P28229 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjc1P28229 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjc1P28229 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc1P28229 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjc1P28229 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjc1P28229 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms