Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Gjc1P28229 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gjc1P28229 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gjc1P28229 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gjc1P28229 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gjc1P28229 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gjc1P28229 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gjc1P28229 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gjc1P28229 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gjc1P28229 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gjc1P28229 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gjc1P28229 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Gjc1P28229 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gjc1P28229 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gjc1P28229 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gjc1P28229 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gjc1P28229 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Gjc1P28229 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gjc1P28229 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Gjc1P28229 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Gjc1P28229 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Gjc1P28229 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gjc1P28229 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gjc1P28229 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gjc1P28229 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Gjc1P28229 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Gjc1P28229 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Gjc1P28229 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Gjc1P28229 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gjc1P28229 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gjc1P28229 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Gjc1P28229 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Gjc1P28229 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Gjc1P28229 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Gjc1P28229 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gjc1P28229 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Gjc1P28229 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gjc1P28229 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gjc1P28229 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gjc1P28229 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gjc1P28229 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Gjc1P28229 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gjc1P28229 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gjc1P28229 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gjc1P28229 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gjc1P28229 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gjc1P28229 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gjc1P28229 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gjc1P28229 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gjc1P28229 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gjc1P28229 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gjc1P28229 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gjc1P28229 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Gjc1P28229 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Gjc1P28229 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gjc1P28229 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gjc1P28229 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gjc1P28229 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gjc1P28229 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gjc1P28229 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gjc1P28229 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gjc1P28229 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gjc1P28229 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gjc1P28229 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gjc1P28229 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Gjc1P28229 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gjc1P28229 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Gjc1P28229 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Gjc1P28229 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Gjc1P28229 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Gjc1P28229 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gjc1P28229 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Gjc1P28229 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Gjc1P28229 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms